Em 1989 o casal Rene e Maria Helena Fontoura fundaram a empresa Frigorífico Fontoura Industrial de Carnes Ltda., que além do abate de bovinos, suínos e ovinos realizava a fabricação de produtos embutidos defumados.
Com a entrada do filho do casal, Felipe, para a empresa, o gosto da família pela charcutaria ficou ainda mais em evidência. Por esse motivo, em 2014 a empresa passou a se dedicar exclusivamente à fabricação de embutidos.
Em 2021, para marcar essa nova fase, nasceu a Fontoura Alimentos que tem como objetivo levar mais sabor e qualidade para mesa de seus clientes, aliando processos artesanais aos critérios de segurança alimentar da indústria.